南京市經信委
南京市經信委增掛“市民營經濟發展辦公室”牌子，市民營經濟工作領導小組辦公室相應調整至市經信委。根據工作需要，適當增加市經信委的內設機構和人員編制。市經信委承擔工業類技術改造投資項目節能評估的審查職責，不再承擔其他固定資產投資節能評估的審查職責。市發改委承擔固定資產投資項目(工業類技術改造投資項目除外)節能評估的審查職責。
南京市投促委
南京市投促委不再保留“市民營經濟發展辦公室”牌子，保留吸引國內大型民營企業來寧設立總部或分支機構，加快發展民營總部經濟等民營經濟招商引資相關職責。
南京市投促委民營經濟招商處更名為港澳臺招商處(國內招商處)，主要承擔港澳臺等重點地區的招商任務，負責推進ECFA和CEPA協議中相關條款在我市的具體落實，協調并跟蹤港澳臺地區重要合作項目的推進工作。參與國內(國資、民資)的相關招商工作。
南京市園林局
組建南京市園林局，為市政府副局級部門管理機構，承擔市城市園林綠化行業主管部門職責。市園林局主要職責為：承擔編制城市綠地系統規劃，組織實施“綠線”和“綠色圖章”管理制度，組織制定各類相關專項規劃和政策法規；指導監督城區范圍內城市綠化、社會綠化和部門綠化；承擔古樹名木管理。
南京市糧食局
保留糧食產業發展處、糧食儲備調控處。設立糧食監督檢查處，負責糧食監督檢查方面工作。市場秩序處(市生豬定點屠宰管理辦公室、糧食流通監管處)不再保留“糧食流通監管處”牌子，相關職能劃轉到單設的糧食監督檢查處。
增加糧食局局長領導職數1名(正局級)，增加正、副處級領導職數各1名。增加市商務局(糧食局)行政編制4名。
事務轉移
服務行業協會事務轉給南京市工商聯
將政府工作部門聯系服務行業協會商會的部分事務，以委托、授權等形式轉移給市工商聯，強化市工商聯對行業協會商會的指導幫助作用，推動市工商聯加強自身建設。
科技成果評價和轉化轉給南京市科協
將政府工作部門組織實施科技成果評價和轉化、科技獎勵、人才評價和獎勵的部分事務，以委托、授權等形式轉移給市科協，強化市科協在科技創新創業方面的服務促進作用，推動市科協加強自身建設。
青年人才引進轉給南京團市委
將政府工作部門組織青年人才引進服務、青年大學生創業就業服務的部分事務，以委托、共同參與等形式轉移給團市委，強化團市委對青年的引領帶動、服務支持作用，推動團市委加強自身建設。
婦女維權信訪維穩轉給南京市婦聯
將政府工作部門承擔的婦女維權、信訪維穩的部分事務，以委托、授權、共建等形式轉移給市婦聯，強化市婦聯對婦女的關愛支持、維護權益作用，推動市婦聯加強自身建設。
困難群體救助等轉給南京市總工會
將政府工作部門承擔的促進就業和職業技能培訓、困難群體救助的部分事務，以委托、授權、共同參與等形式轉移給市總工會，強化市總工會服務職工發展、扶持困難職工的作用，推動市總工會加強自身建設。
婦女勞動保障等轉給南京市婦聯
將政府工作部門承擔的婦女勞動保障的部分事務，以委托、授權、共同參與等形式轉移給市婦聯，強化市婦聯支持帶動婦女發展的作用，推動市婦聯加強自身建設。
