海南省“十二五”期間將組織實施生活源污水處理、工業源廢水污染治理、農業源污染綜合治理、交通流動源廢氣治理和減排能力建設五大減排工程，確保完成國家下達的減排任務。

海南省以提高污水處理率為重點，實施生活污水處理設施建設、升級改造以及管網配套建設工程。到2015年，海南省城鎮污水集中處理率將達到80%以上，中水回用率將達到5%以上，污水處理廠污泥無害化處理率將達到50%以上。

海南省在橡膠、水產品加工等行業中全面推進清潔生產，組織實施廢水深度治理和廢氣脫硫脫硝設施建設。到2015年，海南省重點污染源的工業企業廢水排放達標率將達到97%以上。“十二五”期間，電力、水泥、漿紙、油氣化工等行業的新建燃煤機組、熟料生產線、大型工業鍋爐將全部配套建設脫硫脫硝裝置。

海南大力開展農業源污染綜合治理，推廣生態養殖高新技術。到2015年，海南畜禽規模化養殖率將達到65%以上，規模化畜禽養殖場、養殖小區污染治理率將達到90%以上。

海南建立健全減排管理、監測、服務“三位一體”管理體系，加強污染排放動態監測，提高監測、統計數據的準確性、及時性，實現數據共享。