論壇會員大會
會員大會為論壇的最高權力機構，每年舉行一次。
理事會
理事會是論壇的最高執行機構，由會員大會選舉產生。理事會由 11 名成員組成，秘書長和來自東道地（博鰲）的代表為理事會當然成員，其余 9 名由發起會員、榮譽會員和商業會員中推舉產生。 咨詢委員會 咨詢委員會由發起國前政要、專家、企業界和學術界人士組成。咨詢委員會視論壇需要不定期舉行工作會議，就與論壇相關的重要事務提出咨詢和建議。
秘書處
秘書處是論壇的常設執行機構。負責具體開展論壇的各項活動。秘書長是論壇的首席執行官和秘書處的負責人。現任秘書長：龍永圖。
研究院
研究院是論壇重要的智力支持機構。其主要職能包括：在對世界經濟研究分析基礎上，提出年會主題和議題； 組織起草并發表與論壇業務相關的經濟預測；負責為論壇年會、研討會及其它專題會議提供智力資源；為會員和其它合作方提供人力資源培訓；負責建立亞洲地區乃至全球范圍內工作網絡及信息交流中心。 (本文來源：博鰲亞洲論壇秘書處 )
